eclipse +JPA

Pessoal,

Eu estou desenvolvendo uma aplicação JSE utilizando JPA. Criei uma pasta META-INF dentro do meu src e coloquei o persistence.xml lá. Nos meus testes, a aplicação estava rodando sem problemas, até que eu fui criar um jar da aplicação e mandei o eclipse gerar o MANIFEST.MF para mim. Depois disso, a aplicação não roda mais, dizendo que não está achando o persistence.xml.
Já olhei o diretório bin e vi que o eclipse está exportando o META-INF e o MANIFEST.MF, mas não exporta o persistence.xml. Alguém já passou por isso?

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