é pq há diferenças entre compiladores.
Por algum motivo ainda nao explicado (oficialmente), alguns Projetos/Libs compilados com o Flex Builder 3, por exemplo, nao conseguem ser re-abertos no Flash Builder 4.5, principalmente qnd há Design Mode.

Oq vc precisa fazer é baixar o fonte, e mesmo q nao haja nenhuma altera;áo, recompilar com o 4.5

O Swiz já teve esse problema, qnd lançaram o 1.0, ao adicionar o swc no projeto o design mode nao funcionava mais e dava uma msg avisando q o siwz-frameowkr.swc tinha sido compilado com versao anterior e q era recomendavel compilar com uma versao mais recente.

Nao há explicação oficial do "porquê" desse problema, mas basta baixar os fontes e recompilar (nada complicado).