Codeigniter e wordpress

Há algum problema colocar dentro da raiz do codeigniter uma pasta(com o nome blog, por exemplo) com o wordpress?

Existe uma alguma configuração que tem que fazer, certo? Pros links do wordpress sempre colocarem dominio.com.br/pastaDoWordpress/ como base dos links.

Pergunto pois não queria colocar em um subdominio: subdominio.dominio.com.br.