Eclipse busca por .jar que nem foi utilizado

Instalei o Eclipse Photon e criei somente uma classe porém quando executo ele tenta localizar dezenas de classes que nem foram instanciadas. Segue exemplo abaixo mas tem muitas outras :

Agradeço se tiverem alguma informação.

EX:

jul 18, 2018 6:01:16 PM org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner processURLs
ADVERTÊNCIA: Failed to scan [file:/C:/Program%20Files/Apache%20Software%20Foundation/Tomcat9/lib/class-model.jar] from classloader hierarchy
java.io.FileNotFoundException: C:\Program Files\Apache Software Foundation\Tomcat9\lib\class-model.jar (O sistema não pode encontrar o arquivo especificado)

jul 18, 2018 6:01:16 PM org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner processURLs
ADVERTÊNCIA: Failed to scan [file:/C:/Program%20Files/Apache%20Software%20Foundation/Tomcat9/lib/config.jar] from classloader hierarchy
java.io.FileNotFoundException: C:\Program Files\Apache Software Foundation\Tomcat9\lib\config.jar (O sistema não pode encontrar o arquivo especificado)

jul 18, 2018 6:01:16 PM org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner processURLs
ADVERTÊNCIA: Failed to scan [file:/C:/Program%20Files/Apache%20Software%20Foundation/Tomcat9/lib/auto-depends.jar] from classloader hierarchy
java.io.FileNotFoundException: C:\Program Files\Apache Software Foundation\Tomcat9\lib\auto-depends.jar (O sistema não pode encontrar o arquivo especificado)

jul 18, 2018 6:01:16 PM org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner processURLs
ADVERTÊNCIA: Failed to scan [file:/C:/Program%20Files/Apache%20Software%20Foundation/Tomcat9/lib/javax.inject.jar] from classloader hierarchy
java.io.FileNotFoundException: C:\Program Files\Apache Software Foundation\Tomcat9\lib\javax.inject.jar (O sistema não pode encontrar o arquivo especificado)

jul 18, 2018 6:01:16 PM org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner processURLs
ADVERTÊNCIA: Failed to scan [file:/C:/Program%20Files/Apache%20Software%20Foundation/Tomcat9/lib/hk2-api.jar] from classloader hierarchy
java.io.FileNotFoundException: C:\Program Files\Apache Software Foundation\Tomcat9\lib\hk2-api.jar (O sistema não pode encontrar o arquivo especificado)

jul 18, 2018 6:01:16 PM org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner processURLs
ADVERTÊNCIA: Failed to scan [file:/C:/Program%20Files/Apache%20Software%20Foundation/Tomcat9/lib/osgi-resource-locator.jar] from classloader hierarchy
java.io.FileNotFoundException: C:\Program Files\Apache Software Foundation\Tomcat9\lib\osgi-resource-locator.jar (O sistema não pode encontrar o arquivo especificado)

jul 18, 2018 6:01:16 PM org.apache.tomcat.util.scan.StandardJarScanner processURLs
ADVERTÊNCIA: Failed to scan [file:/C:/Program%20Files/Apache%20Software%20Foundation/Tomcat9/lib/tiger-types.jar] from classloader hierarchy
java.io.FileNotFoundException: C:\Program Files\Apache Software Foundation\Tomcat9\lib\tiger-types.jar (O sistema não pode encontrar o arquivo especificado)

Qual tipo do projeto? Crie um novo projeto do tipo “Java Project” e execute um “Hello World” para testar. Se funcionar, então o problema é o tipo ou as configurações do projeto, mas se der erro, então desinstale o Eclipse (supondo que seja a versão instalada) e baixe esta versão (Windows 64bits):

https://www.eclipse.org/downloads/download.php?file=/technology/epp/downloads/release/photon/R/eclipse-jee-photon-R-win32-x86_64.zip

Para outras versões:

A versão instalável “Eclipse Installer” costuma dar erro, por isso recomendo a versão zip.