Figo, há problema na hora do cálculo no seu if:
if (aluno.getNota1() + aluno.getNota2() + aluno.getNota3()/3 >= media)
Faltam parênteses aí, pois vc tá dividindo a nota3 por 3, e não as 3 notas!Vai dar sempre Aprovado com os valores que vc passou!!!