Talvez por que seja alpha mesmo? 
Se não me falha a memória, quando saiu o 5.5 as primeiras versões eram consideradas alpha e só depois num dos 5.5.x alguma coisa é que eles passaram a considerar estável p/ uso em produção.
Alguém pode confirmar essa informação?
[quote=Luca]Olá
Provavelmente o tomcat não suporta JSR 181 e nem outra coisa qualquer da API de web services.
Mas se você pode instalar o Java Web Services Developer Pack 2.0 e na hora em que o instalador pergunta pelo web container, você aponta para o tomcat. Outra alternativa é não apontar para web container nenhum e copiar os jars na mão.
[]s
Luca[/quote]
Se você tentar executar o Tomcat 6 sobre o Java SE 6.0, que já possui o JAX-WS embutido. Vale a pena 
Depois q eu li esse post do bile blog http://www.jroller.com/page/fate/?anchor=why_i_hate_tomcat eu ate tenho medo de usar tomcat!!!
Ele me acordou pra vida!!!
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