Agora entendi o seu problema. Faz o split passando o limit -1. Tenta assim:
String linha = arquivoVerificar.readLine();
String[] linhaSeparada = linha.split(Pattern.quote("|"), -1);
Agora entendi o seu problema. Faz o split passando o limit -1. Tenta assim:
String linha = arquivoVerificar.readLine();
String[] linhaSeparada = linha.split(Pattern.quote("|"), -1);
o segundo parametro do split é o limit: se vc passar 2 por exemplo, ele vai splittar em 2 partes apenas. Se colocar -1, entendo que é como se tirasse o limite.
Obrigado.