Muito obrigado Vinigodoy e digaoneves…
Usei a seguinte implementação do Vinigodoy:
     public void exportarButton() {       
          new Thread(new Runnable() {
               public void run() {
                 Configurator.configureExportarPanelEdit(ContextExportarDadosPanelEdit.EXPORTAR, exportarDadosPanelEdit, 
                 exportarDadosPanelEdit.getArquivosIntercambioPanel());
                 
                 exportarXmlSemWhere("ICATB_RESERVATORIO");
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_ESTACAO", "EST_ID", listaEstId());   
                 exportarParaXmlComWhere("HDRTB_EST_LOCAL_POLIT_HIDRG", "EPH_EST_ID", listaEstId());
                 exportarParaXmlComWhereSubBacia("HDRTB_SUBBACIA_RIO", listaEphDnsCd, listaEphRioCd);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_AREA_DRENAGEM", "ARD_EST_ID", listaEstId());
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_HIST_COORD_ESTACAO", "HCE_EST_ID", listaEstId());
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_HISTORICO_ESTACAO", "HSE_EST_ID", listaEstId());
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_IMAGEM", "IMG_EST_ID", listaEstId());
                 
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_SECAO_TRANSVERSAL", "SCT_EST_ID", listaEstId());  
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_SECAO_REGUA", "SCR_SCT_ID", listaSctId);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_LINHA_BASE", "LNB_SCT_ID", listaSctId); 
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_LANCE_REGUA", "LCR_SCR_ID", listaScrId);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_MARGEM", "MAR_SCT_ID", listaSctId);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_NATUREZA_MARGEM", "NTM_MAR_ID", listaMarId);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_NATUREZA_LEITO", "NTL_SCT_ID", listaSctId);
                        
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_CARACTERIZACAO_VHM", "CVH_EST_ID", listaEstId());
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_HIST_COORDENADA_CVHM", "HCC_CVH_ID", listaCvhId);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_HIST_OBSERVADOR_CVHM", "HSO_CVH_ID", listaCvhId);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_OBSERVADOR", "OBS_ID", listaHsoObsId);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_ENDERECO", "END_OBS_ID", listaHsoObsId);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_HISTORICO_OPERACAO", "HOC_CVH_ID", listaCvhId);
                 
                 exportarXmlSemWhere("ICATB_LABORATORIO");
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_RESPONSAVEL_LABORATORIO", "RPL_LAB_ID", listaLabId);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_ENDERECO_LABORAT", "ENL_LAB_ID", listaLabId);
                 exportarParaXmlComWhere("ICATB_ENDERECO_RESP_LABORAT", "ENR_RPL_ID", listaRplId);
                 
                 ADFExceptionHandler.displayMessage("Operação realizada com sucesso.");
                 Configurator.configureExportarPanelEdit(ContextExportarDadosPanelEdit.ABRIR, exportarDadosPanelEdit, 
                 exportarDadosPanelEdit.getArquivosIntercambioPanel());
               }
          }).start();
     }  
    /**
     * Exporta os registros de estação com where
     */
     private void exportarParaXmlComWhere(String nomeTabela, String chave, List<String> listaDeIds) {
        Connection con = null;
                        
         try {
           
              con = getConnection();
              Statement stmt = con.createStatement();
              
              String strIdsSelecionados = "";
              List<String> idSelecionados = listaDeIds;
              
              if (idSelecionados.size() > 0) {
              
                 for (String i : idSelecionados) {
                      strIdsSelecionados += i;
                      strIdsSelecionados += ", ";                   
                 }        
      
                 strIdsSelecionados += ";";
                 //remove o último espaço e última vírgula
                 String resIdSelecionados = strIdsSelecionados.replaceAll(", ;", "");  
                 String sql = "SELECT EXPORTA_XML('" + nomeTabela + "' ,'WHERE " + chave + " IN(" + resIdSelecionados + ")') as XML FROM DUAL";
//                 System.out.println(sql);
                 ResultSet rs = stmt.executeQuery(sql);
                 String nomeDoArquivoComExtensao = exportarDadosPanelEdit.getNomeArquivoIntercambioTextField().getText() + "\\" + nomeTabela + ".xml";
                 exportarDadosPanelEdit.getNomeArquivoIntercambioTextField().setText(getPathOndeSeraSalvoOArquivo());
	   
                 while (rs.next()) {
                     exportarDadosPanelEdit.getNomeArquivoExportandoTextField().setText(nomeTabela);
                   exportarDadosPanelEdit.getJLabel1().setText(nomeTabela);
                     System.out.println("Exportando: " + nomeDoArquivoComExtensao);
                      
                     String xml = rs.getString("XML");
                 
                     if(xml != null){
                          makeFile(nomeDoArquivoComExtensao , xml);
                     }
                 }
         } catch (SQLException e) {
             System.out.println("Não foi possível gerar o arquivo para a tabela " + nomeTabela);
             e.printStackTrace();
         }
Funcionou perfeitamente, enquanto o método exportarParaXmlComWhere(…) é executado está sendo atualizado os valores dos campos textFields, labels, etc. Postei apenas parte do código, para vcs terem uma idéia do que eu es 
 :Dtava precisando fazer.
o código:
                 Configurator.configureExportarPanelEdit(ContextExportarDadosPanelEdit.EXPORTAR, exportarDadosPanelEdit, 
                 exportarDadosPanelEdit.getArquivosIntercambioPanel());
chama o contexto (habilita, desabilita, setText, etc) para determinados componentes.
Da mesma forma o código:
                 Configurator.configureExportarPanelEdit(ContextExportarDadosPanelEdit.ABRIR, exportarDadosPanelEdit, 
                 exportarDadosPanelEdit.getArquivosIntercambioPanel());
chama o contexto (habilita, desabilita, setText, etc) para determinados componentes.
Obrigado. 
 
 
 
 