Antes de tudo, sou iniciante em Java. 
Implementei um contador comp, neste método de ordenação, que informava quantas comparações ocorriam ao decorrer do método.
public class BublleSort {
public static void main(String[] args) {
int i, j, k;
int comp = 0;
int vet_size = 100;
int aux;
int[]numbers = new int[vet_size];
for(i=0; i<vet_size; i++) {
numbers[i] = (int)(1+Math.random()*vet_size);
}
for(j=0; j<vet_size; j++) {
for(k=j; k<vet_size; k++) {
if(numbers[j] > numbers[k]) {
aux = numbers[j];
numbers[j] = numbers[k];
numbers[k] = aux;
}
comp++;
}
}
System.out.println("COMPARE: "+comp);
}
}
O código acima é funcional e apresenta a quantidade correta de comparações (5050) para um vetor de 100 posições.
Porém, ao criar um método exclusivo para a ordenação é que o problema surge. A ordenação em si funciona corretamente, mas não sei bem como acessar o parâmetro count do método bublle() para acessar a quantidade de comparações. E se eu puder acessar, não sei se estará correto.
public class BublleTestMethod {
public static void main(String[] args) {
int size = 100;
int count = 0;
int[] array = new int[size];
for(int i=0; i<array.length; i++) {
array[i] = (int)(1+Math.random()*size);
}
long start = System.currentTimeMillis();
bublle(array, count);
long ended = System.currentTimeMillis();
long runtime = ended - start;
System.out.println("RUNTIME: "+runtime+" ms\n");
System.out.println("COMPARE: "+count);
}
public static void bublle(int[]numbers, int comp) {
int aux;
for(int j=0; j<numbers.length; j++) {
for(int k=j; k<numbers.length; k++) {
if(numbers[j] > numbers[k]) {
aux = numbers[j];
numbers[j] = numbers[k];
numbers[k] = aux;
}
comp++;
}
}
}
}
Desde já, agradeço a ajuda.