Dúvida com Programa para geração de busca multi-nível

boolean naoEncontrado = true;
StringBuffer texto = new StringBuffer();
String linha;
int contsemicolon = 0;
// Procura a primeira ocorrência do texto procurado
while (naoEncontrado) {
    linha = br.readLine();
    if (linha == null) break;
    if (linha.toLowerCase().indexOf(oQueProcuro.toLowerCase()) > -1 ) {
        sb.append(linha);
    }
}

// Procura duas ocorrências do ;
// É importante checar se a linha lida anteriormente possui o ;
if (sb.toString().indexOf(";") > -1) contsemicolon++;

while(contsemicolon < 2) {
// aqui você vai ler do arquivo e verificar se existe o ;
// não esqueça de adicionar o texto ao sb independente de possuir ou não o ;, ok?
linha = br.readLine();
    if (linha == null) break;
    sb.append(linha);
    if (linha.toLowerCase().indexOf(";") > -1 ) {
        contsemicolon++;
    }
}

public class ComsWindowReader {

	public static void main(String[] args) throws ComsWindowReaderException {
		// Lê do teclado o nome da window
		Scanner scanner = new Scanner(System.in);

		System.out.println("Digite o nome da window: ");

		// leitura da window
		String dadoProcurado = scanner.next(); //args[0]  substituir depois - Lembrete

		System.out.println("Listagem da window: " + " "+ dadoProcurado +" ");

		FileReader fr = null;
		BufferedReader br = null;

		// endereco do arquivo
		final String CAMINHO_ARQUIVO = "c:" + File.separator + "unifiles"
		+ File.separator + "Coms-Window.txt";
 
		try {

			// Declaracao do TreeMap que armazena a window e suas
			// características.
			TreeMap<String, String> mapaWindow = new TreeMap<String, String>();

			// Referência do arquivo a ser lido.
			File f = new File(CAMINHO_ARQUIVO);

			// objetos de leitura do arquivo.
			fr = new FileReader(f);
			br = new BufferedReader(fr);

			// linha corrente do arquivo
			String linha;

			// guarda um buffer com os dados da window
			StringBuffer bufferDadosWindow = new StringBuffer();

			// controla o numero de semiColons encontrados para cada window.
			int numeroSemiColon = 0;

			// enquanto esse flag for true, concatena as linhsa do arquivo para
			// cada window.
			boolean encontrouItemProcurado = false;

			int numeroLinha = 1;

			while ((linha = br.readLine()) != null) {
				try {
					linha = linha.substring(0, 72);

				} catch (Exception e) {
					throw new ComsWindowReaderException(
							"Formato de arquivo inválido. "
							+ "Não foi possível separar a linha "
							+ numeroLinha
							+ "do arquivo com 72 caracteres.");
				}

				// verifica se existe na linha corrente a window desejada
				if (linha.toLowerCase().indexOf(dadoProcurado.toLowerCase()) > 0) {
					encontrouItemProcurado = true;
				}

				// controla o numero de semicolons que definem quais linhas
				// compôem os dados da window.
				if (linha.indexOf(";") != -1) {
					numeroSemiColon++;
				}

				/*
				 * Controla se a linha lida faz parte da window passada por
				 * parâmetro. Se não for possível quebrar a linha em 72
				 * caracteres, entende-se que o arquivo está mal formado e uma
				 * exceção é lançada.
				 */
				if (encontrouItemProcurado == true) {
					try {
						linha = linha.substring(0, 72);
					} catch (Exception e) {
						throw new ComsWindowReaderException(
								"Formato de arquivo inválido. "
								+ "Não foi possível separar a linha "
								+ numeroLinha
								+ "do arquivo com 72 caracteres.");
					}
					bufferDadosWindow.append(linha).append("\n");
					mapaWindow.put(dadoProcurado, bufferDadosWindow.toString());

				}

				/*
				 * quando encontra o segundo semicolon, significa que os dados
				 * da window já acabaram. Sendo assim, seta o item procurado
				 * para false e seta o flag numeroSemiColon para 0 para evitar
				 * cópia de linhas indesejadas
				 */
				if (numeroSemiColon >= 2) {
					encontrouItemProcurado = false;
					numeroSemiColon = 0;
				}

				// incrementa o número de linhas lidas no arquivo
				numeroLinha++;
			}

			Set<String> listaEncontrados = mapaWindow.keySet();
			Iterator<String> it = listaEncontrados.iterator();
			
			// impressao
			while (it.hasNext()) {
				String chaveMapa = it.next();
				System.out.println(mapaWindow.get(chaveMapa));
			}
		} catch (FileNotFoundException e) {
			throw new ComsWindowReaderException(
					"Erro ao tentar abrir o arquivo. Arquivo inexistente. Detalhes do erro. "
					+ e.getMessage());
		} catch (IOException e) {
			throw new ComsWindowReaderException(
					"Erro na manipulação de arquivo . Detalhes do erro. "
					+ e.getMessage());
		} finally {
			if (br != null) {
				try {
					br.close();
				} catch (IOException e) {
					throw new ComsWindowReaderException(
							"Erro ao tentar fechar arquivo. Detalhes do erro. "
							+ e.getMessage());
				}
			}
		}
	}
}

if (linha.indexOf(";") > -1) {
     numeroSemiColon ++;
     if (numeroSemiColon > 1) {
          break;
     }
}
sb.append(linha);