Um comportamento chato que ocorre às vezes no Windows e todas as vezes no Linux (Ubuntu), é o seguinte:
Depois de utilizar o Eclipse e/ou o Azureus, verifico que os mesmo permanecem na memória.
Quando volto a usar o Eclipse, o mesmo me dá a mensage "Workspace em uso…"
Ocasionalmente ocorre isso também no Windows.
No meu caso é o contrário. No Rwindows, o NetBeans fica na memória as vezes. O problema sempre foi os plugins. No NetBeans, descobri que era o plugin do Grails que dava um pau danado e deixava ele na memória mesmo depois de fechado.
As vezes acontece qdo não consigo dar stop no GlassFish.
No Eclipse Europa jamais ocorreu.