Eclipse permanece na memória mesmo depois de sair da IDE

Senhores.

Um comportamento chato que ocorre às vezes no Windows e todas as vezes no Linux (Ubuntu), é o seguinte:

Depois de utilizar o Eclipse e/ou o Azureus, verifico que os mesmo permanecem na memória.
Quando volto a usar o Eclipse, o mesmo me dá a mensage "Workspace em uso…"
Ocasionalmente ocorre isso também no Windows.

O Netbeans trabalha normalmente.

Poderia ser o SWT?

Abraços.

Ah, antes de mais nada:
Java 1.6.0_03
Eclipse 3.3.1.1 (Europa)
Ubuntu 7.10

No meu caso é o contrário. No Rwindows, o NetBeans fica na memória as vezes. O problema sempre foi os plugins. No NetBeans, descobri que era o plugin do Grails que dava um pau danado e deixava ele na memória mesmo depois de fechado.
As vezes acontece qdo não consigo dar stop no GlassFish.
No Eclipse Europa jamais ocorreu.

Abraços e boa sorte