Foi o que eu pensei.
Mesmo assim eu ainda não compreendo para q construir um WEB e um desktop (ainda mais q esse último será oculto, pelo que eu entendi).
Se a aplicação no “desktop” é oculta, não há usuabilidade alguma para o usuário, e não entendo no que isso melhoraria a vida de um programador.
pode ser que eu esteja viajando…
mas imagine… um Chefe de Obra e um Pedreiro… Um sabe de Tudo… e o outro Faz tudo…
mais ou menos assim… 
Abraços!
E o quê essa aplicação no Desktop iria fazer?
Essa parte eu entendi, mas browser e desktops são views, e eu não vejo motivo pra vc separar o chefe do pedreiro, até pq, isso não afetará o modo q o usuário trabalhará devido a aplicaçãozinha ser oculta, logo, não tem motivo/razão/circunstância ao meu ver. Mas, vc poderia especificar o q essa aplicação no desktop realmente faria.