olá
parece até engraçado, mas o readLine() comeu mesmo, testem ai
import java.io.FileWriter;
import java.io.FileReader;
import java.io.BufferedWriter;
import java.io.BufferedReader;
import java.io.IOException;
public class criaArquivo {
public static void main(String[] args){
try {
BufferedWriter arquivo = new BufferedWriter(new FileWriter("novo.txt"));
arquivo.write("teste da silva e silva");
arquivo.newLine();
arquivo.write("teste da linha2");
arquivo.close();
System.out.println(arquivo);
System.out.println();
System.out.println();
System.out.println();
System.out.println();
BufferedReader ler = new BufferedReader(new FileReader("novo.txt"));
do{
System.out.println(" " + ler.readLine());
}while(ler.read() > 0);
ler.close();
}
catch (IOException e) {
e.printStackTrace();
}
}
}
abraço
PS: editado devido a analfabetisse. 
No do while você está usando o método read() que retorna o próximo caracter. Então ele retornou o primeiro da linha e o readLine() pegou o resto a partir dali. Faça assim:
BufferedReader ler = new BufferedReader(new FileReader("novo.txt"));
String line = "";
while( (line = ler.readLine()) != null){
System.out.println(" " + line);
}
ler.close();
Exatamente isso Guilherme…
Da uma do quando encontramos uma questao interessante, sabemos a resposta, e alguem ja foi mais rapido que voce. O bom eh que muitas vezes alguem aj ate escreveu uma resposta mais educada e completa, como foi o caso aqui do Guilherme. Isso que faz do GUJ um lugar legal. parabens!
Realmente, o GUJ é um lugar muito legal, pela cooperação entre os desenvolvedores JAVA, e como eu estava estudando para a certificação e estava justamente estudando o Capitulo 6, referente a esse tópico, achei interessante e resolvi dar uma olhada… hehehe.
Geralmente antes de procurar algo no google, faço uma procura aqui no site e sempre encontro algo parecido com meus problemas… e em muitas vezes encontro as respostas.
Parabéns a todos…
entendi
quando executo o comando
linha = ler.readLine();
o conteudo da primeira linha já foi parar no valor da variavel linha.
interessante…
@Paulo Silveira: é mesmo o GUJ é muito bom… mesmo a pergunta sendo fácil para muitos, o pessoal ainda responde sem dar patada! pelo menos num tomei nenhuma 
Outra coisa bacana é q qnd o pessoal quer codigo pronto, todo mundo xinga ele rsrsrsr
aki vagal nao se cria nao. mais se a pessoa pelo menos tentar a ponto de ter duvidas ja recebe todo o apoio possivel
é mesmo!!!
código pronto num rola, tem que dar o caminho das pedras.
abraço