[RESOLVIDO] Criação de um método genérico para alterar um List<>

Você deve abstrair o reset desses ID’s. Para isso, recomendo a criação de uma interface, ex.:

public interface IdResettable {
    void resetId();
}

Com essa interface criada, faça as classes que deverão ter o id resetado implementar essa interface e, consequentemente, implementar o método resetId, ex.:

public class Benfeitoria implements IdResettable {
    private Integer id;

    // implemente o método resetId fazendo o reset de acordo com o atributo da classe
    public void resetId() {
        this.id = null;
    }
}

Depois, altere o método genérico para:

private <T> List<T> resetIds(List<T> lista){
    List<T> objs = new ArrayList<T>();
    for(IdResettable item : lista){
       item.resetId();
       objs.add((T) item);
    }
    return objs;
}

Não testei o código, mas a ideia é essa. Abstrair o reset do id, mantendo a implementação do reset em sua respectiva classe.

Além da sugestão do lucastody vc também pode usar o design pattern reflection, para procurar por um método no seu objeto e lançar o parametro que esse método espera. Caso voce não queira alterar suas classes de dominio implementando uma interface.

Ou percorra essa lista, verifica qual a classe que o objeto pertence com instanceof e faça o cast para determinada classe, daí pra frente vc utiliza os métodos da classe como quiser. Boa sorte.

Só complementando, o método genérico deve usar extends :

private <T> List<T extends IdResettable > resetIds(List<T extends IdResettable > lista){
    List<T> objs = new ArrayList<T>();
    for(IdResettable item : lista){
       item.resetId();
       objs.add((T) item);
    }
    return objs;
}

Me atendeu perfeitamente. Obrigado pela explicação @Lucas_Camara e pelo complemento da resposta @rmendes08