[RESOLVIDO]Eliminar linhas em branco/vazia de um txt

Ola galera, bom tenho o script abaixo que remove alguns blocos de textos pré-definidos, porem preciso também de remover as linha vazias.
Para executa-lo faço assim: java ProcessadorTexto arquivoOriginal.txt ArquivoNovoManipulado.txt
Encontrei aqui no forum e em outros lugares várias formas de fazer isso, porem não consegui adaptar a nenhum a este código.

Desde já muito obrigado.

import java.util.*;   
import java.io.*;   
//import java.poi.*;   

public class ProcessadorTexto {   
  
    public static void main(String[] args) {   
        // verifica se há dois argumentos   
        if (args.length != 2) {   
            falhar("Uso: java ProcessadorTexto ARQUIVO NOVO_ARQUIVO");   
        }   
        // verifica se o arquivo de entrada realmente existe   
        File entrada = new File(args[0]);   
        if (!entrada.exists()) {   
            falhar("Arquivo de entrada não encontrado");   
        }   
        // verifica se o arquivo de saída não existe ainda   
        File saida = new File(args[1]);   
        if (saida.exists()) {   
            falhar("Arquivo de saída já existe");   
        }   
        // verifica se a pasta onde o arquivo será salvo já existe   
        // e, se não existir ainda, cria   
        File pastaSaida = saida.getParentFile();   
        if (pastaSaida != null && !pastaSaida.mkdirs()) {   
            falhar("Não foi possível criar diretório onde será salvo o arquivo");   
        }   
        // cria o arquivo de saída vazio   
        try {   
            if (!saida.createNewFile()) {   
                falhar("Não foi possível criar o arquivo de saída");   
            }   
        } catch (IOException e) {   
            falhar("Não foi possível criar o arquivo de saída: " + e.getMessage());   
        }   
        // cria o Scanner para ler e o PrintWriter para escrever   
        Scanner sc = null;   
        PrintWriter pw = null;   
        try {   
            sc = new Scanner(entrada);   
            pw = new PrintWriter(saida);   
            // enquanto houverem mais linhas na entrada   
            while (sc.hasNextLine()) {   
                String linha = sc.nextLine();   
                // escreve na saída o valor alterado
				linha = linha.replaceAll("%!", "");
				linha = linha.replaceAll("%%DocumentMedia: papel1 595 842 75 white normal", "");
				linha = linha.replaceAll("%%+papel2 595 842 75 blue azul", "");
				
				pw.println(linha);
            }   
            // informa que tudo correu bem   
            System.out.println("Arquivo processado com sucesso!");   
        } catch (FileNotFoundException e) {   
            // como verificamos se os arquivos existiam antes, isso não deve ocorrer   
            // mesmo assim é boa prática capturar e tratar essa exceção   
            System.err.println("Não foi possível econtrar arquivo: " + e.getMessage());   
        } finally {   
            // para finalizar, fechamos os recursos que usamos   
            if (sc != null) {   
                sc.close();   
            }   
            if (pw != null) {   
                pw.flush();   
                pw.close();   
            }   
        }   
    }   
       
    /**  
     * Esse método mostra a mensagem de erro e encerra a JVM com um código de  
     * erro: <code>System.exit(1)</code>.  
     */   
    private static void falhar(String mensagem) {   
        System.err.println(mensagem);   
        System.exit(1);   
    }   
  
}  

Tente substituir a linha 50 por:

if(!linha.trim().equals("")) pw.println(linha);
Isto é, só grave no arquivo de saída somente se a linha for diferente de vazio.
O método trim() é para eliminar espaços da linha.

Bruno funcionou perfeitamente, muito obrigado.