SQL - Insert com apóstrofe

Apóstrofe é uma figura de linguagem que designa coisas como “Ave Maria” (Veja aqui).
Você certamente não está tendo problema com isto, mas com um apóstrofo.
Isto ocorre por que você provavelmente use JDBC com java.sql.Statement e ele é, além de inseguro, bem chato.
Sugiro que estude java.sql.PreparedStatement, isso já resolverá teu problema.

Na verdade estou usando o Hibernate…mas como não sei qual é o tipo de dado que está vindo no xml…e para não dar conflito de chaves primárias no banco, pois estou trabalhando com dois bancos, tendo que manter as suas chaves… sendo que a de um banco vai de 0 a 100000 e a do outro vai de 100000 a 200000… então gero um insert dinâmico e digo pro hibernate executar isso…

Mas mesmo com nativeQuery é possível determinar os parâmetros que se está usando.
Dá uma olhada aqui