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Olá!
Esses arquivos textos tem algum formato específico? Eu conheço mesmo frameworks muito simples de usar que pegam XMLs (ou JSON ou qualquer outra estrutura em árvore) e transformam em objetos Java (ou vice-versa) como o JDOM, o XStream.
O que você pode fazer é criar um parser que lê o(s) arquivo(s) batendo uma RegEx e daí você pode preencher um arquivo ou gerar o XML da maneira que você preferir.
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