Vou te passar um URL do "Open Book Project" na parte "How to think like a computer scientist". Eu apenas dei uma "folheada" por que as coisas enrolaram eu não tive tempo de começar a estudar, mas me pareceu ser bem legal.

http://ibiblio.org/obp/thinkCS/

Tem também o "C++ Programming Tutorial" (achei problemático pq não dá pra imprimir ou baixar) mas tb parece ser bem legal

http://cplus.about.com/od/beginnerctutorial/l/blcplustut.htm

Mas... uma olhadinha no google dá 1 zilhão de hits.

Talvez precisará de compiladores. Se estiver usando *nix provavelmente já terá um compilador C++ instalado no seu sistema. Se estiver usando windows poderá obter o Borland C++ command line tools 5.5, ou então usar o MinGW/MSYS (Minimalist GNU) e usar o GCC:

http://www.mingw.org/

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Esse louds é sacana - o ARM (Annotated Reference Manual) não é nem um pouco fácil de se ler. Coisa para quem já sabe bem o C++ e precisa saber alguma sutileza (por exemplo, como é que foi definida a "template specialization" ou outros recursos que não estão correta ou uniformemente implementados em todos os compiladores).
Se for fácil de arranjar o livro do Deitel (talvez você possa pedi-lo emprestado) então leia-o. Muita gente acha-o melhor que o livro do Deitel sobre Java (isso não quer dizer que seja o melhor livro sobre C++...)
Você precisa do C++ só por causa do JNI, ou você realmente quer saber C++ para ter na sua caixa de ferramentas? (Como você é da Poli, talvez precise do C e talvez do C++ para poder programar algum dispositivo, ou escrever um driver de hardware, ou até ajudar no kernel do Linux )

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