Olá!
Quero opiniões dos programadores de plantão pra me ajudar. 
Eu quero criar um sistema para desktop e utilizar python é funcional?
Agradeço. 
Funcional é. Você só pode ter problemas na hora de distribuir a aplicação, já que precisará enviar o interpretador Python junto. No Linux isso não é um problema tão grande pois você pode colocar as dependências em um pacote, mas no Windows é mais complicado. Além disso o código ficará disponível para livre alteração do usuário.
Compila.
O Py2exe compila o programa Python e todas as dependências, o que torna fácil a distribuição de programas Python em ambiente Windows!
Já ví programas feitos com IronPython, você utiliza componentes .NET para isso: