Applet ácessando código nativo no Linux

Oi Pessoal…

Eu estava desenvolvendo uma aplicação Java que é acessada através de um portal e deve interagir com este portal. Entre outras coisas, esta aplicação tem um player de vídeo embutido. A visualização do vídeo pode ser modificada em função de anotações de meta-dados. O player que incorporo na aplicação utiliza código nativo que é invocado através de um bind.

Consegui resolver o problema da distribuição do código nativo para Windows criando um instalador que joga todas as Dll´s necessárias na pasta System32 do Windows. Seto o caminho da aplicação para esta pasta e tudo funciona. Minha aplicação deve rodar em Linux também e o player oferece bibliotecas para este SO. No entanto, não consegui imaginar como faria isto em linux.

Existe alguma pasta no Linux que seja análoga à System32 do Windows, para estes fins? Como posso distribuir este código. Ou seja, como posso oferecer uma alternativa ao instalador que fiz para windows que faça o mesmo no linux?