Por que um arquivo .jar no Windows pode ser “executado” com um duplo clique e no Linux não?
depende do linux que você está usando… quando você clica num arquivo jar dependendo do linux ele abre o arquivo. Se você clicar em abrir com e selecionar a jre é provável que ele funcione… Agora comparar linux com windows é meio complicado não? 
Eu não quis comparar os dois S.O.s
Apenas quis saber porque essa diferença de comportamento do arquivo .jar nesses dois sistemas.
Depende da associacao do tipo do arquivo…
Aqui no meu windows do trabalho qdo clico no jar ele abre o jar no PowerArchive!!!
Eh soh fazer a associacao no linux tb!!!
vc tem que indicar a associacao dos seus aquivos .jar para ele abrirem com a linha de comando java -jar, isso vc encontra nas suas propriedades, no windows o duplo clique pra execucao de qualquer aplicativo e padrao, mas vc pd mudar isso nas propriedades do seu SO, :joia: