Backup e restore

Instale a ferramenta administrativa MySql Query Browser disponível no site do MySql.
Selecione o menu Ferramentas-> MySql Administrator
Existe a opção de Backup e Restore.

ou

Faça a cópia do diretório data do MySQL  para fazer o backup, depois é só sobreescrever o diretório para fazer a restauração.

[]s

import java.io.File;

import java.io.FileInputStream;

import java.io.FileOutputStream;

import java.io.IOException;

import java.nio.channels.FileChannel;

public class CopiaArquivos {
    

    public CopiaArquivos() {
        
        File a = new File("DIRETORIO_MYSQL\data\SEU_BANCO_DE_DADOS");
        File[] arqs = a.listFiles();
        String erros = "";
        for (int i=0;i<arqs.length;i++){
            try {
                    // Create channel on the source
                    FileChannel srcChannel = new FileInputStream("DIRETORIO_MYSQL\data\SEU_BANCO_DE_DADOS\"+arqs[i].getName()).getChannel();
                
                    // Create channel on the destination
                    FileChannel dstChannel = new FileOutputStream("C:\teste\"+arqs[i].getName()).getChannel();
                
                    // Copy file contents from source to destination
                    dstChannel.transferFrom(srcChannel, 0, srcChannel.size());
                
                    // Close the channels
                    srcChannel.close();
                    dstChannel.close();
                } catch (IOException e) {
                    erros += "\n"+i+" - "+e.toString();
                }
        }        
    }
}

String novonome = null;
            int numerodobackup = 0;
            
            File diretorio = new File("C:/teste1");
            File bck = new File("C:/teste1/almoxarifado.sql");
            
       
            if(!diretorio.isDirectory()) {
              new File("C:/teste1").mkdir();
             
            } else {  
            }
            
            // Cria Arquivo de Backup
            try {
                if(!bck.isFile()) {
                    
                    
                        String comando="C:\Arquivos de programas\MySQL\MySQL Server 5.0\bin\mysqldump.exe";   
                        ProcessBuilder pb=new ProcessBuilder(comando,"--user=root","--password=adm","almoxarifado","--result-file=C:\teste1\almoxarifado.sql");   
                        pb.start(); 
                        JOptionPane.showMessageDialog(this, "Cópia de segurança realizada com sucesso","Backup",JOptionPane.CLOSED_OPTION);
               
                } else {
                    while(bck.isFile()) {
                        numerodobackup ++;
                   
                        bck = new File("C:/teste1/almoxarifado"+numerodobackup+".sql");
                        novonome= String.valueOf(bck);
                         
                        }

                            String comando="C:\Arquivos de programas\MySQL\MySQL Server 5.0\bin\mysqldump.exe";   
                            ProcessBuilder pb=new ProcessBuilder(comando,"--user=root","--password=adm","almoxarifado","--result-file="+novonome);   
                            pb.start(); 
                            JOptionPane.showMessageDialog(this, "Cópia de segurança realizada com sucesso!","Backup",JOptionPane.CLOSED_OPTION);
                            dispose();
                }
                } catch (IOException ex) {
                ex.printStackTrace();
                
                JOptionPane.showMessageDialog(this, "Copia de segurança não realizada!","Backup",JOptionPane.CLOSED_OPTION);
                }

mysql -u root --password=12345 teste < a.sql