Uma dica para Fazer Backup no Windows,
para linux basta ajustar os comandos para o Shell
depois de pesquisar um dia …
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Tendo o Mysql 5.X instalado
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Criei um Arquivo.BAT com as linhas abaixo:
C:
CD/Arquivos de programas/MySQL/MySQL Server 5.0/bin/
mysqldump -h IPdoHOST -u USUARIO --password=SENHA MEU_BANCO > COPIA_do_MEU_BANCO.SQL
- Agora pela aplicacao java, é so axecutar o Arquivo.bat
Espero que ajude muita gente 
:idea: