Olá pessoal,
Alguém sabe como devo proceder para debugar um código Javascript no netbeans?
Usualmente você usa o debugador do próprio browser, mas dependendo você pode usar um conector (como o que permite debugar código Javascript no Chrome). Um exemplo do que estou falando:
https://netbeans.org/kb/docs/webclient/html5-js-support.html
Entretanto, eu recomendaria sempre debugar usando alguma extensão do próprio browser. No caso do Firefox existe o Web Developer e o Firebug.