Como setar um context-param no web.xml atraves de um metodo?

Os context-param e init-param são parâmetros carregados na inicialização da aplicação no servidor. A princípio você não pode altera-los em tempo de execução (read-only).

Atributos, por outro lado, são mais ou menos como variaveis globais, que são visiveis nos contextos de Aplicação, Sessão ou Requisição. Esses você pode alterar a vontade.

Entao nao tem como setar em tempo de execucao…

?

infelizmente não.