Por exemplo, eu quero usar GridLayout para uma parte da minha janela e BorderLayout na ultima, como eu uso dois gerenciadores de leiaute ?
Coloque dois paineis na sua tela. Possivelmente, eles terão que estar sobre outro painel, que definirá a posição dos dois painéis.
Então qual painel eu usaria pra colocar os dois ? E como usaria esse painel ?
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Depende de como você queira desenhar a tela. Mas é só pensar que qualquer painel pode ter qualquer gerenciador de leiaute, e que um painel pode ter outros painéis dentro.