Comparação de aúdio

Olá!
Estou precisando de uma ajuda, preciso comparar dois aúdios, sendo que um é o base, e o outro meu app irá gravar através de uma ligação skype…
Ou seja, estou com problema quanto a frequencia do audio, ja que por usar a internet ele tem bastante variação na frequencia…Alguém poderia me ajudar? Abcs.