Comparar arquivos txt

Olá tenho dois arquivos txt eles diferentes tendo parecido só o codigo a comparar.
O problema e o seguinte eu tenho o primeiro arquivo com um monte de numeros que forma o codigo do funcionario
e no outro eu tenho o nome e o codigo desse funcionario eu tenho que gerar um terceiro arquivo txt informando quantas
vezez o codigo do funcioanrio aparece.
Se puderem me ajudar,

consulte Strings, scanner, regex

esse site é muito bom pra isso http://google.com

valew

não teria como me ajudar só para dar uma luz para min só o começo