Conectar uma aplicação desktop com um banco de dados MySQL hospedado em um servidor web

Não há impedimento algum desde que vc. efetue uma conexão via vpn ou qualquer outro meio e tenha permissão de acesso pode efetuar o acesso assim:
1- Driver =" org.gjt.mm.mysql.Driver".
url ou caminho da rede=jdbc:mysql://[hostname][:porta]/
ususario= user name.
senha: password.

Vc. pode criar uma classe conexão…:

"

…

private Connection conn;

private Statement st;

…

//tua instancia

Class.forName(“org.djt.mm.mysql.Driver”);

this.conn = DriverManager.getConnection(“jdbc:mysql://localhost:3306/meusDados_sql” + "?user=root&password=gujBrasil ");

this.st = conn.createStatement();

…
e por ai vai…

Eu posso utilizar o driver MySQL Connector da própria MySQL AB? Senão, onde encotro esse driver do qual você falou?