Console do Eclipse

Boa tarde pessoal,

eu estou compilando e rodando um código através do console do eclipse.
Meu código não é em JAVA por isso estou usando a external tools.

O fato é o seguinte, eu consigo rodar o meu código certinho. O que está acontecendo
é que esse meu código abre uma janela externa ao console e essa janela que é uma
view (para visualizar os resultados) está abrindo atrás da janela do Eclipse e eu gostaria
que ela abrisse na frente do console. Quando eu executo o código pelo console do windows,
a janela exterior que abre, sempre sobrepoe o console.
Eu preciso utilizar o console do eclipse pois se trata de uma rcp. Alguém tem alguma ideia de
como fazer a janela exterior abrir na frente da janela do eclipse e não atrás?

Grato desde já.