Alguém conhece alguma biblioteca ou tem uma sugestão de como eu poderia fazer isso de forma programática na linguagem Java?
Você pode usar uma API como ODFtoolkit ou jOpenDocument, que permitem criar, acessar e editar documentos odf (textos odt, planilhas ods, etc).
Veja mais aqui: http://opendocumentformat.org/developers/ .
Abraço.