Criar .jar a partir de uma classe específica

Olá, tenho um projeto do netbeans com varias classes que fazem tarefas específicas, todas que são instanciadas e executadas a partir de uma classe chamada Principal.
Porém, em outro pacote no mesmo projeto eu tenho uma classe chamada Configuracoes, aonde ela carrega um .txt e le configurações. Eu gostaria de criar dois arquivos .JAR, um pro primeiro conjunto de classes e outro pra essa classe configuração.
No netbeans a primeira vez que criamos o .jar ele pede qual classe podemos escolher pra ser aquela que será executada quando abrirmos o .jar. Porém não acredito que seja uma boa solução visto que se eu fizer assim os 2 JARs vão conter todas as classes do projeto, eu gostaria que cada um tivesse suas proprias classes.
Como posso fazer isso?