Criar uma fonte de dados ODBC no Windows

Use um driver JDBC proprio (mysql, firebird) e acesse o banco diretamente, sem ODBC

Não use Access.
De qualquer maneira, se não puder evitar isso, você deve saber que existem três tipos de ODBC Data Sources: user, system e file (“File DSN”). As duas primeiras são dados do registry, e a terceira é em um arquivo.
O driver ODBC-JDBC do Access trabalha com file data sources? Se trabalhar, fica bem mais fácil porque você pode fazer o seguinte: crie um arquivo “File DSN”, e depois modificar o arquivo. Um exemplo desse arquivo:

[ODBC]
DRIVER=Driver do Microsoft Access (*.mdb)
UID=admin
UserCommitSync=Yes
Threads=3
SafeTransactions=0
PageTimeout=5
MaxScanRows=8
MaxBufferSize=2048
FIL=MS Access
DriverId=281
DefaultDir=C:\suaaplicacao
DBQ=C:\suaaplicacao\NWIND.MDB