Dúvida Aplicação WEB

Digamos que o diretório dos professores seja o nome, e para este exemplo suponhamos que estão na raiz na pasta professores, o exemplo abaixado retornará somente a pasta do professor informado, assim você poderá manipular todos os arquivos e subpastas do professor informado =)

public File getFileTeacher(String name) {
		File file = new File("C:\\professores");
		String nameFolder = "";
		for(String string: file.list()){
			File fileTeacher = new File(file, string);
			if(fileTeacher.isDirectory()){
				System.out.println(fileProfessor);
				nameFolder = fileTeacher.getName();
				System.out.println(nameFolder);
				if(nameFolder.compareTo(name) == 0){
					return fileTeacher;
				}
			}
		}
		return null;
	}

Na solução do ederfreitas, certifique-se do acesso de escrita a pasta (em especial no linux).
Para fazer com banco de dados, use o tipo CLOB para armazenar os arquivos.

É melhor fazer o envio dos documentos de todos os professores para um unico diretorio no servidor e atravez de Banco de dados (nem sei se é possivel) fazer a separação? ou é melhor criar um diretorio para cada professor?

Abço.