Dúvida com JDesktopPanel

vc apenas que “setar o local” da barra da janela minimizada??

sim, por exemplo:
tenho um internal frame maximizado dentro de um desktop pane, quando minimizo o internal frame a barra de titulo dele fica visivel ao lado esquerdo na parte inferior do desktop pane, gostaria de saber se tem como setar alguma propriedade para que sua barra de titulo fique ao lado direito inferior do desktoppane

Não sei se funcionaria com ele minimizado, mas tente usar o método reshape…

public void reshape(int x, int y, int width, int height)