Dúvida com While

import java.math.*;

 public class Teste {
 	public static void main(String[] args) {
    
        ...
        // Você não precisa, e aliás não é recomendado, usar um LineNumberReader. 
        // Use um BufferedReader, que é mais rápido 
        BufferedReader in = new BufferedReader (inputStreamReader));
        // Não use "ready", pois ele não é confiável se o "reader" não for um arquivo.
        String linha;
        // Defina os "estados" da sua aplicação. 
        // Por exemplo, se você ler uma linha que começa por 1, você vai para o estado 1.
        // Se dentro do estado 1 você ler uma linha que começa por 2, você vai para o estado 2.
        
        // No código abaixo, suponho que a primeira linha começa por 1. 
        boolean parar = false;
        // Em vez disso, leia a linha dentro da comparação do while.
        while ( !parar && (linha = in.readLine()) != null) {
             if (linha.startsWith ("01")) {
                  blablabla...
             } else if (linha.startsWith ("02")) {
                  blablabla...
             } else...
        }
        
        in.close(); // só é preciso fechar o "stream" mais interno, não os outros encapsulados.
    }
}

while(in.ready()){
        String temp = in.readLine();
 	if(temp.startsWith("01")){
 	        String temp2 = in.readLine();
 		while (temp2.startsWith("02")) {// aqui qdo a linha fosse 01 era para sair do laço, mas não sai
 		        System.out.println("Entrou no while");
 			temp += temp2;
 			System.out.println(temp);
 			temp2 = in.readLine(); // AQUI!!! vc tem que ler a próxima linha, do jeito que está fazendo vc está o tempo todo parado na mesma linha
 		}
 		System.out.println(temp);
 	}
}