Duvida na hora de salvar projeto

Boa noite a todos…
Minha duvida é a seguinte: eu programo em uns dois not books diferentes e sempre salvo meus projetos no pen-drive…
Bem, na hora mudar de um not para outro eu sempre recrio as minhas clsasses e saio copiando e colando os codigos
que estao no pen-drive para as classes novas, pois quando tento abrir o projeto do pen-drive de novo o eclipse nao aceita…
isso ta enchendo a paciencia… alguem tem alguma solucao mais flexivel para o meu problema??desde ja agradeço a qualquer ajuda.