você cometeu 2 erros
o primeiro ao importar as libs do iReport para o seu projeto… o iReport possui libs para usar gráficos (freeChart), libs e dependencias para conversar com top link com jpa, hibernate, libs para exportar para diversos formatos, libs pra conversar com vários bancos de dados, além de libs da propria aplicacao… sua aplicação usa tudo o que o iReport oferece ao ponto de vc precisar importar tudo?
caso não, apenas importe as libs que descrevi em
http://www.guj.com.br/posts/list/113455.java
e caso exporte para pdf ou xls ou qq outro formato, as suas respectivas libs (iText.jar ou jxl.jar)
o seu segundo erro, o que originou o problema, é que você apontou no seu classpath as libs da pasta lib do iReport… não copiou, apenas referenciou… logo como desinstalou o iReport, a pasta com todas as libs foram pro espaço 
te recomendo o seguinte… COPIE da pasta lib do iReport os jars que precisa e coloca no classpath da tua aplicação