Dúvidas sobre exercício de Arrays da apostila da Caelum

class Funcionario

{

String nome;

String departamento;

double salario;

String dataEntrada;

String rg;

boolean estaNaEmpresa;  // se está ativo ou não

void bonifica(double aumento, boolean ativo)
{
	if (estaNaEmpresa==ativo)
	{
		salario += aumento;
		System.out.println("Bonificação permitida. Funcionário(a) em atividade.");
	}
	else
	{
		System.out.println("Bonificação não permitida. Funcionário(a) demitido(a).");
	}
}

class Empresa

{

Funcionario[] empregados;

String cnpj;

String nome;

// int contador;

// contador = 0;

void adiciona(Funcionario f, int contador)
{
	empregados[contador] = f;
}

void mostraFuncionarios()
{
	for(int i = 0; i<this.empregados.length; i++)
	{
		System.out.println("Funcionários na posição: " + i);
		System.out.println("Salário desta posição: R$ " + empregados[i].salario);
	}
}

class TestaEmpresa

{

public static void main(String[] args)

{

Empresa empresa = new Empresa();

empresa.empregados = new Funcionario[10];

for (int i = 0; i<empresa.empregados.length;i++)
	{
		Funcionario f = new Funcionario();
		f.salario = 1000 + i * 10;
		empresa.adiciona(f,i);
	}
	empresa.mostraFuncionarios();
}