Enviando dados para outros aplicativos

Dê uma olhada na documentação da classe java.lang.Runtime especialmente nos métodos 'exec' que retornam um Process. O uso deste mátodo é um tanto quanto 'tricky', procure por exemplos na web, com isso vc consegue o quer.

import java.io.*; 
import java.util.*; 

public class Maple { 
        //definindo a variável de entrada e o comando a ser executado no maple
	static String cmd = "a := int(x^2,x); save a, `Maple_out.txt`; quit" ;
        
        /*
        	Os dois últimos comandos da lista acima ('save a, `Maple_out.txt`' e 'quit') só foram colocados para garantir o teste da classe.
        	
        	
        	A resposta do maple ao comando em 'cmd 'não está sendo armazenada na variável abaixo (static PrintWriter out), cheguei a esta 
        	conclusão pelo debug do programa.
        	
        	Também não funciona o método close() que deveria fechar a sessão do programa Maple
        */
        
        //definindo a variável de saída do maple
	static PrintWriter out;
	private Process process; // processo usado para executar o maple
	private OutputStream maple_input; 
	private BufferedReader maple_output; 
	public Maple() throws IOException { 
		this.process = Runtime.getRuntime().exec("cmaple.bat -q");
		this.maple_input = process.getOutputStream(); 
		this.maple_output = new BufferedReader(new InputStreamReader(process.getInputStream())); 
	} 

	// Método para fechar a sessão do maple
	public void close() throws IOException { 
		String quit = "quit\n"; 
		maple_input.write(quit.getBytes()); 
		maple_input.flush(); 
		try{ process.waitFor(); } catch(InterruptedException ex) {} 
	} 

	// Método para executar o comando da string 'cmd' e escrever os resultados na variável 'out'. 
	public synchronized void exec(String cmd, PrintWriter out) throws IOException, NullPointerException { 
		// executando o comando da string 'cmd'
		String Cmd = cmd + ";\n"; 
		maple_input.write( Cmd.getBytes() ); 
		maple_input.flush(); 

		// Armazenando os comandos em um log
		System.out.println("> "+ cmd + ";"); 

		// Para detectar o fim das saídas do Maple para o comando em 'cmd' e colocando a string 'terminator_cmd' no fim
		String terminator_cmd = "JAVA: END OF A MAPLE COMMAND IS HERE"; 
		maple_input.write( ("printf(`" + terminator_cmd + "\\n`):\n").getBytes() ); 
		maple_input.flush(); 

		// Lendo a saída, linha a linha, antes de terminator_cmd ser lido: 
		String s; 
		while(true) { 
			s = maple_output.readLine(); 
			if (s.indexOf(terminator_cmd) != -1 ) { 
				break; 
				} 
			if (out != null) { 
				out.println(s); 
			} 
		} 
	} 
		//para criar uma nova instância executável da classe Maple
        public static void main( String args[] ) throws IOException, NullPointerException {
         Maple teste = new Maple();
         teste.exec( cmd, out );
         teste.close();
     }
}