Erro: Could not parse configuration: hibernate.cfg.xml

Posta o arquivo hibernate,cfg.xml inteiro.

Utilize

jdbc:mysql://localhost/estimacao

Observe o username e password, parecem estar errados, geralmente utilizamos o mesmo nome da database no username

Estou tentando entender qual a ligação entre a configuração de conexão com o erro de não ter sido possível ler o arquivo xml.

Estou tentando entender onde voce viu ele falando que o erro foi de leitura do arquivo…
Mas se o erro for de leitura aqui vai a pergunta, voce está utilizando Maven? Observou se o arquivo xml se encontra na pasta META-INF?

No título do tópico, bem claro, escrito: could not parse configuration. hibernate.cfg.xml

Nesta minha parca experiência em programação, eu entendo que could not parse se refere à impossibilidade de concluir a “leitura” de um arquivo por alguma razão.
Como ele postou só parte do arquivo cfg.xml, não tem como verificar, de maneira mais adequada, o que pode ter ocorrido (esqueceu alguma tag, esqueceu de fechar alguma tag, esqueceu alguma declaração de namespace, etc).
E, sobre tua sugestão, a declaração do host está correta, basta prestar atenção a isso

Além do que, erros referentes a conexão seriam exibidos como SQLException e não como HibernateException, como é o caso.

@darlan_machado editei o arquivo cfg.xml, coloquei completo agora, se tiver mais algumas considerações a fazer, ficarei grato.
Olhei as tags a princípio tudo certo.

Cara, já consegui identificar o erro.
Você precisa trocar essa parte

<!DOCTYPE hibernate-configuration PUBLIC 
	"-//Hibernate/Hibernate Configuration DTD 3.0//EN"
	"http://www.hibernate.org/dtd/hibernate-configuration-3.0.dtd">

Por essa

<!DOCTYPE hibernate-configuration PUBLIC
    "-//Hibernate/Hibernate Configuration DTD 3.0//EN"
    "http://hibernate.sourceforge.net/hibernate-configuration-3.0.dtd">

Na verdade, é devido a segunda parte, ao invés de www.hibernate.org, você precisa ter o hibernate.sourceforge.net

Tenta aí e avisa.

@darlan_machado, fiz a alteração, no entanto o erro persistiu.
A fim de diminuir o tamanho do erro no console, comentei o restante do código e mantive apenas a codificação mínima no método GerarTabelas:

public static void main(String[] args) {
    GerarTabelas();
}

private static void GerarTabelas() {
    AnnotationConfiguration cfg = new AnnotationConfiguration();
    //cfg.configure("hibernate.cfg.xml");
    //SchemaExport sx = new SchemaExport(cfg);
    //sx.create(true, true);
}

Na execução do arquivo, o seguinte erro é exibido no console do IDE:

jul 19, 2018 3:50:16 PM org.hibernate.annotations.common.reflection.java.JavaReflectionManager 
<clinit>
INFO: HCANN000001: Hibernate Commons Annotations {4.0.4.Final}
jul 19, 2018 3:50:16 PM org.hibernate.Version logVersion
INFO: HHH000412: Hibernate Core {4.3.1.Final}
jul 19, 2018 3:50:16 PM org.hibernate.cfg.Environment <clinit>
INFO: HHH000206: hibernate.properties not found
jul 19, 2018 3:50:16 PM org.hibernate.cfg.Environment buildBytecodeProvider
INFO: HHH000021: Bytecode provider name : javassist

Mesmo com a redução do log de erro não consegui identificar o problema.

Opa, perai.
Agora o erro é diferente.

Este erro ocorre quando você tenta criar uma instância de objeto da classe Configuration, da seguinte maneira

Configuration cfg = new Configuration(); //Tenta buscar o arquivo hibernate.properties.

Se você quer que ele busque pelo hibernate.cfg.xml, você precisa instanciar da seguinte maneira:

Configuration cfg = new Configuration().configure(); //Tenta buscar o arquivo hibernate.cfg.xml

Particularmente, eu acho desnecessário utilizar o hibernate.cfg.xml, principalmente se você está utilizando mapeamento através de anotações nas entidades.

@darlan_machado qual recurso você utiliza ao invés do hibernate.cfg.xml em casos que é utilizado mapeamento através de anotações nas entidades? Se possível me envie um exemplo, estou iniciando agora em Java Web.

Eu utilizo o mapeamento via hibernate.properties.
Eu “aprendi” hibernate com configuração total por xml, como eu odeio XML com todas as minhas forças, sempre busquei alternativas.
Quando descobri que poderia usar o mapeamento em arquivo de properties, comecei a estudar e a usar.
A meu ver é muito mais tranquilo e produtivo.
Mas essa é a minha opinião.

Achei o problema, como eu estou desenvolvendo um sistema novo estou me baseando em um sistema pré-existente, e não atentei quanto a versão do Hibernate que estava importado no projeto. Estava utilizando uma versão do Hibernate muito mais atualizada do que a do sistema pré-existente, alguns métodos estão como deprecated no novo Hibernate.
Solução: Removi a versão atualizada do meu projeto e importei uma versão anterior do hibernate, incrivelmente tudo está funcionando perfeitamente.
Obrigado colegas pela ajuda!