Faça o seguinte:
Crie o famoso Hello World em Java num arquivo txt, e rode em linha de comando mesmo. Se rodou tudo OK, a versão Java do seu computador tá OK, pode ser o pacote do Eclipse. Desinstale, baixe novamente no site do Eclipse.
Se não rodou, o Java do seu computador não está OK. Veja se está configurado certo os paths do Java nas variáveis de ambiente, e se for o caso, desinstale e reinstale o Java.