Existe rodar uma Classe em background (Segundo Plano)?

Galera, como no Linux existe rodar uma classe em Segundo Plano???

Estou usando RMI, e minha aplicação está no Tomcat, tem como colocar uma classe para iniciar e deixar direta pelo tomcat??? ou tenho que rodar pelo Windows mesmo???
Já que o RMI necessita de uma Classe servidora inicializada, pessoal qual é a melhor maneira de fazermos isso???

Obrigado.
Vitor Oliveira