FatJAR - URGENTE

Olá … tenho a seguinte estrutura de arquivos:

  • Project
    – src
    — com
    — core
    — test
    — tools
    ---- arquivo .jar
    — files
    ---- hosts.desc

Estou gerando o meu file.jar com o fatJar, ele está exportando todos esses diretorios, mas quando executo meu main que precisa do files/hosts.desc como args[0] ocorre a mensagem de erro de que não encontrou o arquivo ou diretorio files/hosts.desc.

Acho que o fatJar não está exportando corretamente, alguem pode me ajudar? Ou como eu faço para o .jar ler esse arquivo?

Grato.