Ferramenta para iniciar

Oi pessoas! Sou inciante do mundo Java e estou precisando de umas dicas de como utilizar por exemplo o eclipse como um ferramenta de desenvolvimento de Java. Estou fazendo minha tese de pos graduação na Escola Paulista de Medicina e realmente o mundo java pra mim esta sendo tudo novo. Alguém conhece algum tutorial que eu possa esta olhando ou alguma dica de outra ferramenta para isso.
Grato marcos_sp