Guardar codigo e procurar atraves da linha de comandos

Boas, tou com a duvida que como posso guardar qualquer coisa (codigo) de maneira que depois possa buscar atraves da linha de comandos. pensei que seria atraves de alocaçao dinamica na memoria (malloc) mas nao sera isso, alguem me pode dar uma dica por favor?

Sua dúvida é muito confusa.
Você quer fazer uma aplicação ou para gerenciar seu código fonte?

Se quiser algo mais que comentários, tanto no Eclipse quanto Netbeans tem a função Task.

pretendo guardar uma matriz para depois procura la atraves da linha de comandos. dp o utilizador vai introduzir valores e eu tenho que elaborar um programa que veja se os valores apresentados na consolo: matriz sao os correctos para a resoluçao do exercicio.

Tive a ler varias partes de C e encontrei uma parte de manipulaçao de ficheiros, atraves de fopen, penso que deve servir para o meu caso, mas se por acaso souber e me puder dar uma dica agradeço.

cumprimentos (: