Na conexão do SQLite via JDBC utilizo o seguinte código:
Connection conn = DriverManager.getConnection(“jdbc:sqlite:sample.db”, config.toProperties());
O segundo parâmetro (config.toProperties(), tem algumas configurações do sqlite, ex: ativar suporte a chaves estrangeiras), a dúvida é: como passar essas informações para o Hibernate, segue trecho do hibernate.cfg.xml
org.sqlite.JDBC
jdbc:sqlite:sample.db