Incluindo Scripts no meu programa java

Estou começando com programação em java. E necessito fazer uma aplicação que execute determinados scripts que tenho. Utilizo o Netbeans e gostaria de saber se é possível executar estes scripts dentro do meu código ou mesmo dar um comando para que ele seja executado.

Que tipos de Script?!?!?

Se for scripts to tipo .bat, .sh, etc:
http://java.sun.com/j2se/1.4.2/docs/api/java/lang/Runtime.html#exec(java.lang.String)

Se for scripts que manipulam classes java:
http://www.beanshell.org
http://groovy.codehaus.org

valeu por enquanto galera, eu vou tentar isso