Jar + filters executam no tomcat, mas não no glassfish

Oi gente, é o seguinte, tenho uma série de JAR’s feitos pela empresa para a autenticação que deveriam entrar no momento em que qualquer páginas é solicitada. No tomcat, com os mesmos filters configurados no web.xml, roda perfeitamente sem nenhum problema. Já no glassfish ele consegue chamar a página do projeto passando em cima do autenticador.

Pergunta: O glassfish não consegue manipular filters da mesma forma do tomcat? Eu tenho que configurar algo no admin do glassfish para que ele execute os jars?