Java em baixo nível [dúvida]

Cara, acho que se você apontar para esse arquivo e ler os seus bytes, basta você gravar, por exemplo, metade dos bytes em um novo arquivo e a outra metade em um outro novo arquivo…
Pronto! Agora você tem um arquivo dividido em dois. Pra testar se isso funciona mesmo, depois leia esses arquivos separados e junte os bytes criando um único arquivo e checa se essa “gambiarra” corrompeu alguma coisa…

[]'s.

E como eu faço isso?

Cara, dá uma lida nessas 2 classes:
http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/io/FileInputStream.html
http://java.sun.com/javase/6/docs/api/java/io/FileOutputStream.html
Se você entender o propósito dessas 2 streams, a sua pergunta estará respondida… =]

[]'s.